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Konferenzbeitrag

Integrated Data Repository Toolkit: Werkzeuge zur Nachnutzung medizinischer Daten für die Forschung

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Text/Conference Paper

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Datum

2012

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Verlag

Gesellschaft für Informatik e.V.

Zusammenfassung

Medizinische Daten werden in Forschung und Routineversorgung zunehmend elektronisch erhoben und gespeichert. Hierdurch ergeben sich erhebliche Nachnutzungspotentiale z.B. im Sinne von Feasibility-Analysen oder einer Rekrutierungsunterstützung. Die notwendige Aufbereitung der Rohdaten und Bereitstellung in geeigneten Auswertungswerkzeugen stellen jedoch eine Hürde für die Realisierung dieser Potentiale dar. Im Rahmen des beschriebenen Projekts wurden zunächst Anforderungen und Anwendungsszenarien für die Nachnutzung medizinischer Daten erhoben. Anschließend wurde das Integrated Data Repository Toolkit auf Basis der Open Source-Komponenten i2b2 und Talend Open Studio konzipiert und implementiert. Das Toolkit unterstützt Forschungsverbünde bei der Inbetriebnahme der i2b2-Plattform sowie der Aufbereitung medizinischer Rohdaten durch einen flexibel anpassbaren ETL-Prozess (Extraction, Transformation & Loading).

Beschreibung

Ganslandt, T.; Sax, U.; Löbe, M.; Drepper, J.; Bauer, C.; Baum, B.; Christoph, J.; Mate, S.; Quade, M.; Stäubert, S.; Prokosch, H. U. (2012): Integrated Data Repository Toolkit: Werkzeuge zur Nachnutzung medizinischer Daten für die Forschung. INFORMATIK 2012. Bonn: Gesellschaft für Informatik e.V.. PISSN: 1617-5468. ISBN: 978-3-88579-602-2. pp. 1252-1259. Regular Research Papers. Braunschweig. 16.-21. September 2012

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