Logo des Repositoriums

Auflistung nach Autor:in "Menzel, Peter"

1 - 3 von 3
  • Konferenzbeitrag
    Maximum likelihood estimation of weight matrices for targeted homology search
    (German conference on bioinformatics 2009, 2009) Menzel, Peter; Gorodkin, Jan; Stadler, Peter F.
    Genome annotation relies to a large extent on the recognition of homologs to already known genes. The starting point for such protocols is a collection of known sequences from one or more species, from which a model is constructed – either automatically or manually – that encodes the defining features of a single gene or a gene family. The quality of these models eventually determines the success rate of the homology search. We propose here a novel approach to model construction that not only captures the characteristic motifs of a gene, but are also adjusts the search pattern by including phylogenetic information. Computational tests demonstrate that this can lead to a substantial improvement of homology search models.
  • Konferenzbeitrag
    Tanimoto’s Best Barbecue: Discovering Regulatory Modules using Tanimoto Scores
    (German conference on bioinformatics – GCB 2007, 2007) Menzel, Peter; Stadler, Peter F.; Mosig, Axel
    We present a combinatorial method for discovering cis-regulatory modules in promoter sequences. Our approach combines “sliding window” approaches with a scoring function based on the so-called Tanimoto score. This allows to identify sets of binding sites that tend to occur preferentially in the vicinity of each other in a given set of promoter sequences belonging to co-expressed or orthologous genes. We bench- mark our method on a data set derived from muscle-specific genes, demonstrating that our approach is capable of identifying modules that were identified as functional in previous studies.
  • Konferenzbeitrag
    Universelle Kommunikation für optimalen Kundenservice bei LVM
    (INFORMATIK 2003 – Innovative Informatikanwendungen, Band 1, Beiträge der 33. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 2003) Schmidt, Werner; Reufsteck, Horst; Menzel, Peter
    Die LVM bekommt durch eine innovative Kommunikationslösung, die mobile und stationäre Arbeitsplätze miteinander vernetzt, die laufenden IT-Kosten in den Griff und steigert den Kundenservice. Das Rückgrat der hierdurch verbesserten Geschäftsprozesse bei der LVM-Gruppe bildet eine nahtlose Vernetzungsplattform von T-Systems und T-Mobile, welche eine leistungsfähige Integration von Festnetz (mit T-ATM) und Mobilfunk (mit Mobile IP VPN) eröffnet. Dem Mitarbeiter steht – sei es z. B. in der Rolle eines Außendienstmitarbeiters beim Kundenbesuch oder eines im Home Office arbeitenden Angestellten – ein identischer, vollständiger Arbeitsplatz zur Verfügung, verbunden mit dem Zugriff auf alle aktuellen Unternehmensdaten und Kalkulationsverfahren. Der vorliegende Beitrag zeigt am Beispiel der LVM, in welcher Weise man derartige Netzwerke aufbaut. Er stellt darüber hinaus dar, dass durch die Nutzung umfangreicher Carriernetze Ineffizienzen des Netzwerkes, die sich schrittweise nach einer Erstimplementierung aufgrund sich laufend verändernder Rahmenbedingungen des Netzbetriebs ergeben, weniger schnell auftreten und leichter zu beheben sind. Dazu werden zunächst die Ausgangssituation und die Herausforderungen beschrieben, bevor die wesentlichen Elemente der Lösung dargestellt werden. Den Abschluss bildet ein Ausblick auf weiterführende Nutzungen des Netzwerks, insbesondere mit Blick auf die Multimedia-Beratung für Versicherungskunden.