Auflistung nach Autor:in "Wingender, Edgar"
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- TextdokumentBioinformatik & Bioinformation – Braunschweig spielt eine führende Rolle(40 Jahre Informatik an der Technischen Universität Braunschweig 1972 - 2012, 2012) Schomburg, Dietmar; Wingender, EdgarDie Bioinformatik ist eine vor ca. 20 Jahren entstandene wissenschaftlicher Disziplin, die Informatik-Werkzeuge für die Bearbeitung biologischer Fragestellungen einsetzt. Insbesondere die Entwicklung neuer Algorithmen und Datenbanken und die Integration außergewöhnlich umfangreicher Datenmengen spielen hier eine entscheidende Rolle. Die schnelle Entwicklung der Bioinformatik hat die heutige biowissenschaftliche Forschung erst ermöglicht. Bei der Etablierung des Gebietes in Deutschland und im Hinblick auf die internationale Sichtbarkeit hat Braunschweig eine führende Rolle gespielt.
- KonferenzbeitragComposite module analyst: A fitness-based tool for prediction of transcription regulation(German Conference on Bioinformatics 2005 (GCB 2005), 2005) Kel, Alexander; Konovalova, Tatiana; Waleev, Tagir; Cheremushkin, Evgeny; Kel-Margoulis, Olga; Wingender, EdgarFunctionally related genes involved in the same molecular-genetic, biochemical, or physiological process are often regulated coordinately Such regulation is provided by precisely organized binding of a multiplicity of special proteins (transcription factors) to their target sites (cis-elements) in regulatory regions of genes. Cis-element combinations provide a structural basis for the generation of unique patterns of gene expression. Here we present a new approach for defining promoter models based on composition of transcription factor binding sites and their pairs. We utilize a multicomponent fitness function for selection of that promoter model fitting best to the observed gene expression profile. We demonstrate examples of successful application of the fitness function with the help of a genetic algorithm for the analysis of functionally related or co-expressed genes as well as testing on simulated data.
- KonferenzbeitragFrom composite patters to pathways – Prediction of key regulators of gene expression(German Conference on Bioinformatics 2004, GCB 2004, 2004) Kel, Alexander; Voss, Nico; Konovalova, Tatyana; Tchekmenev, Dmitri; Wabnitz, Philipp; Kelmargoulis, Olga; Wingender, Edgar