Konferenzbeitrag
Integrated Data Repository Toolkit: Werkzeuge zur Nachnutzung medizinischer Daten für die Forschung
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2012
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Gesellschaft für Informatik e.V.
Zusammenfassung
Medizinische Daten werden in Forschung und Routineversorgung zunehmend elektronisch erhoben und gespeichert. Hierdurch ergeben sich erhebliche Nachnutzungspotentiale z.B. im Sinne von Feasibility-Analysen oder einer Rekrutierungsunterstützung. Die notwendige Aufbereitung der Rohdaten und Bereitstellung in geeigneten Auswertungswerkzeugen stellen jedoch eine Hürde für die Realisierung dieser Potentiale dar. Im Rahmen des beschriebenen Projekts wurden zunächst Anforderungen und Anwendungsszenarien für die Nachnutzung medizinischer Daten erhoben. Anschließend wurde das Integrated Data Repository Toolkit auf Basis der Open Source-Komponenten i2b2 und Talend Open Studio konzipiert und implementiert. Das Toolkit unterstützt Forschungsverbünde bei der Inbetriebnahme der i2b2-Plattform sowie der Aufbereitung medizinischer Rohdaten durch einen flexibel anpassbaren ETL-Prozess (Extraction, Transformation & Loading).