P020 - Informatik 2002 - Informatik bewegt - Ergänzungsband
Auflistung P020 - Informatik 2002 - Informatik bewegt - Ergänzungsband nach Titel
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- KonferenzbeitragAlgorithmic challenges in mass spectrometry and systems biology(Informatik bewegt: Informatik 2002 - 32. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.v. (GI), Ergänzungsband, 2002) Schwikowski, BennoCell biology is in the middle of a paradigm change where approaches focusing on the biochemically oriented understanding of single genes are slowly replaced by the systems approach that views systems of genes and proteins in their network context [1]. In this talk we will examine a number of new computational challenges associated with this approach, from various aspects of interpreting peptide mass spectra, to the visualization and integration of heterogenous data types in the molecular network context [2-5].
- Konferenzbeitrag"BundOnline 2005 – die nächsten Schritte der eGovernment-Initiative des Bundes"(Informatik bewegt: Informatik 2002 - 32. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.v. (GI), Ergänzungsband, 2002) Zypries, Brigitte
- KonferenzbeitragFachdatenbanken und Internet-Quellen: Rechercheüberstieg durch Anfragetransfer(Informatik bewegt: Informatik 2002 - 32. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.v. (GI), Ergänzungsband, 2002) Strötgen, RobertDie Sonderfördermaßnahme CARMEN1 zielte unter anderem darauf ab, die Erweiterung von Recherchen in bibliographischen Fachdatenbanken ins Internet zu verbessern. Dabei war das Problem der semantischen Heterogenität zu behandeln, die durch unterschiedliche Inhaltserschließung in verschiedenen Datenbeständen auftritt. Dazu wurden verschiedene Ansätze wie Metadatenextraktion aus Internetquellen und Anfragetransfers über Cross-Konkordanzen und statistisch erzeugte Relationen gewählt. Dieser Aufsatz stellt das Konzept und die Implementierung der Anfragetransfers sowie die Evaluation der Auswirkungen auf das Retrievalergebnis vor.
- KonferenzbeitragFußball spielende Agenten(Informatik bewegt: Informatik 2002 - 32. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.v. (GI), Ergänzungsband, 2002) Liebermann, KurtRoboterfußballsysteme gelten als ideale Testplattform für Forschungen im Bereich autonomer, kooperierender Multiagentensysteme. Autonomie bei gleichzeitiger Kooperation – das ist die Aufgabe, der sich jedes Robotsoccer-Team zu stellen hat. Die Fußball spielenden Agenten des Dortmund University Robot Soccer Teams bedienen sich bei der Lösung ihrer Aufgaben eines weiteren Agenten, des Coaches.
- KonferenzbeitragGeometric problems and algorithms in computer-aided molecular design(Informatik bewegt: Informatik 2002 - 32. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.v. (GI), Ergänzungsband, 2002) Rarey, MatthiasComputer-Aided Molecular Design describes a research area covering all kinds of computer applications in the design of molecules having desired properties. It is widely applied for the design of bioactive molecules like pharmaceuticals or agricultural products. From the computer scientists perspective, computer-aided molecular design contains a large variety of computational problems, often geometric and/or combinatorial in nature. In the introductory part of this talk, a short overview of these problems is given. The main focus in this talk will be on protein-ligand docking. The aim of a docking calculation is to predict, whether two molecules bind to each other (i.e. form an energetically favorable complex). If they do so, one is interested in the geometry of the molecular complex and in the binding energy. The most prominent variant is protein-ligand docking. Here the first molecule is a protein while the second molecule is a small compound. Since most drug targets are proteins and most drugs are small compounds, software for protein-ligand docking is extensively used in pharmaceutical research. Since 1993, we are developing the software package FlexX which belongs to the most widely used codes for protein-ligand docking. An outline of the underlying models, the applied algorithms as well as some examples will be presented.
- KonferenzbeitragGraph drawing algorithms for bioinformatics(Informatik bewegt: Informatik 2002 - 32. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.v. (GI), Ergänzungsband, 2002) Kaufmann, MichaelGraph drawing has recently received growing attention as various techniques have been developed for applications in areas ranging from software technology to business modeling, from network administration to cognitive sciences. Recently, we have designed and realized the tool yWays to support the analysis of biochemical pathways by visualization. In the talk, we will use this tool as a example to discuss to what extend the standard layout algorithms can be used, and what the challenges are to achieve 'real' applicability.
- KonferenzbeitragGrid computing: A new dimension of the Internet(Informatik bewegt: Informatik 2002 - 32. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.v. (GI), Ergänzungsband, 2002) Gentzsch, WolfgangThe Grid is a distributed computing architecture for accessing Computing, data resources and scientific instruments over the Internet, in much the same way that electricity is delivered over thePower Grid today. It is the next logical step, from Internet, to WorldWide Web, now to technology infrastructure which connects distributed computers, storage devices, mobile devic es, instruments, sensors, data bases, and software applic a- tions, and provides uniform access for the user community. The Grid is the evolving next generation of the Advanced Web, for computing, collaboration and the NSF NCSA Na- tional Technology Grid; NetSolve for accessing and sharing mathe matical software; Nimrod for campus-wide resource sharing; SETI@Home for searching for extraterrestrial intelligence; the CERN DataGrid, processing Petabytes of particle data per year (starting in 2006) from its Large Hadron Collider experiment; or the APGrid connecting many computer centers in Asia and the Pacific Rim, in the near future.
- KonferenzbeitragIndex structures for large sequence data: suffix trees and affix trees(Informatik bewegt: Informatik 2002 - 32. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.v. (GI), Ergänzungsband, 2002) Stoye, JensRoboterfußballsysteme gelten als ideale Testplattform für Forschungen im Bereich autonomer, kooperierender Multiagentensysteme. Autonomie bei gleichzeitiger Kooperation - das ist die Aufgabe, der sich jedes Robotsoccer-Team zu stellen hat. Die Fußball spielenden Agenten des Dortmund University Robot Soccer Teams bedienen sich bei der Lösung ihrer Aufgaben eines weiteren Agenten, des Coaches.
- KonferenzbeitragIntegration of data management and analysis for genome research(Informatik bewegt: Informatik 2002 - 32. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.v. (GI), Ergänzungsband, 2002) Brendel, VolkerTechnological advances in genome research have produced unprecedented volumes of genetic and molecular data that now provide the context for any biological research. However, data access, curation, and analysis have remained challenging areas for continued research and development and often prove to be the bottleneck for scientific progress.